Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bop1P97452 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bop1P97452 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bop1P97452 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bop1P97452 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bop1P97452 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms