Protein–RNA interactions for Protein: P97376

Frg1, Protein FRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frg1P97376 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frg1P97376 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frg1P97376 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frg1P97376 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frg1P97376 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frg1P97376 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frg1P97376 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frg1P97376 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frg1P97376 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frg1P97376 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frg1P97376 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frg1P97376 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frg1P97376 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frg1P97376 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frg1P97376 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frg1P97376 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frg1P97376 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frg1P97376 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frg1P97376 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frg1P97376 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frg1P97376 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frg1P97376 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frg1P97376 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frg1P97376 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frg1P97376 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frg1P97376 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frg1P97376 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frg1P97376 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frg1P97376 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Frg1P97376 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frg1P97376 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frg1P97376 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frg1P97376 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frg1P97376 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frg1P97376 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frg1P97376 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frg1P97376 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frg1P97376 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frg1P97376 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frg1P97376 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frg1P97376 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Frg1P97376 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Frg1P97376 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Frg1P97376 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Frg1P97376 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Frg1P97376 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frg1P97376 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frg1P97376 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frg1P97376 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frg1P97376 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frg1P97376 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frg1P97376 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frg1P97376 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frg1P97376 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frg1P97376 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frg1P97376 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frg1P97376 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frg1P97376 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frg1P97376 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frg1P97376 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frg1P97376 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frg1P97376 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Frg1P97376 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frg1P97376 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frg1P97376 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frg1P97376 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frg1P97376 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frg1P97376 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frg1P97376 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frg1P97376 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frg1P97376 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frg1P97376 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frg1P97376 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Frg1P97376 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frg1P97376 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frg1P97376 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frg1P97376 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frg1P97376 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frg1P97376 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frg1P97376 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frg1P97376 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frg1P97376 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frg1P97376 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frg1P97376 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frg1P97376 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frg1P97376 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frg1P97376 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frg1P97376 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frg1P97376 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frg1P97376 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frg1P97376 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frg1P97376 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frg1P97376 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Frg1P97376 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frg1P97376 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frg1P97376 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frg1P97376 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frg1P97376 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frg1P97376 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frg1P97376 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms