Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SmsP97355 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SmsP97355 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SmsP97355 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SmsP97355 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SmsP97355 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SmsP97355 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SmsP97355 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SmsP97355 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SmsP97355 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SmsP97355 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SmsP97355 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SmsP97355 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SmsP97355 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SmsP97355 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SmsP97355 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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SmsP97355 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SmsP97355 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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SmsP97355 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SmsP97355 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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SmsP97355 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SmsP97355 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SmsP97355 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SmsP97355 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SmsP97355 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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SmsP97355 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SmsP97355 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SmsP97355 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SmsP97355 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SmsP97355 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SmsP97355 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SmsP97355 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SmsP97355 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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SmsP97355 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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SmsP97355 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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SmsP97355 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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SmsP97355 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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SmsP97355 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SmsP97355 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SmsP97355 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SmsP97355 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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SmsP97355 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SmsP97355 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SmsP97355 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SmsP97355 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SmsP97355 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
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SmsP97355 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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SmsP97355 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SmsP97355 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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SmsP97355 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SmsP97355 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SmsP97355 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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SmsP97355 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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