Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms