Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Irx1P81068 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Irx1P81068 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Irx1P81068 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Irx1P81068 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Irx1P81068 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Irx1P81068 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Irx1P81068 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx1P81068 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms