Protein–RNA interactions for Protein: P70414

Slc8a1, Sodium/calcium exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8a1P70414 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms