Protein–RNA interactions for Protein: P70321

Hoxb13, Homeobox protein Hox-B13, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb13P70321 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb13P70321 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms