Protein–RNA interactions for Protein: P70257

Nfix, Nuclear factor 1 X-type, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfixP70257 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NfixP70257 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NfixP70257 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NfixP70257 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NfixP70257 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NfixP70257 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NfixP70257 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NfixP70257 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NfixP70257 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NfixP70257 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NfixP70257 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NfixP70257 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NfixP70257 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NfixP70257 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NfixP70257 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NfixP70257 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NfixP70257 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NfixP70257 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NfixP70257 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NfixP70257 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NfixP70257 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NfixP70257 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NfixP70257 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NfixP70257 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NfixP70257 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NfixP70257 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NfixP70257 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NfixP70257 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NfixP70257 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NfixP70257 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NfixP70257 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NfixP70257 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NfixP70257 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NfixP70257 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NfixP70257 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NfixP70257 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NfixP70257 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NfixP70257 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NfixP70257 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NfixP70257 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NfixP70257 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NfixP70257 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NfixP70257 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NfixP70257 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfixP70257 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfixP70257 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfixP70257 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfixP70257 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfixP70257 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfixP70257 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfixP70257 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfixP70257 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfixP70257 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfixP70257 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfixP70257 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfixP70257 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NfixP70257 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfixP70257 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfixP70257 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfixP70257 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfixP70257 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfixP70257 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfixP70257 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfixP70257 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NfixP70257 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfixP70257 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfixP70257 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfixP70257 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfixP70257 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfixP70257 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfixP70257 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfixP70257 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfixP70257 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfixP70257 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfixP70257 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfixP70257 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NfixP70257 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NfixP70257 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NfixP70257 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NfixP70257 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NfixP70257 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NfixP70257 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NfixP70257 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NfixP70257 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NfixP70257 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NfixP70257 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NfixP70257 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NfixP70257 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NfixP70257 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NfixP70257 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NfixP70257 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NfixP70257 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NfixP70257 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NfixP70257 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NfixP70257 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NfixP70257 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NfixP70257 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NfixP70257 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NfixP70257 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NfixP70257 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms