Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Hoxd13P70217 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms