Protein–RNA interactions for Protein: P70196

Traf6, TNF receptor-associated factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf6P70196 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf6P70196 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf6P70196 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf6P70196 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf6P70196 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf6P70196 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf6P70196 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Traf6P70196 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Traf6P70196 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms