Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms