Protein–RNA interactions for Protein: P62751

Rpl23a, 60S ribosomal protein L23a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl23aP62751 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms