Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms