Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Csrnp3P59055 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Csrnp3P59055 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Csrnp3P59055 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Csrnp3P59055 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Csrnp3P59055 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Csrnp3P59055 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Csrnp3P59055 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Csrnp3P59055 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Csrnp3P59055 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csrnp3P59055 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csrnp3P59055 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csrnp3P59055 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csrnp3P59055 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csrnp3P59055 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csrnp3P59055 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csrnp3P59055 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csrnp3P59055 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csrnp3P59055 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Csrnp3P59055 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csrnp3P59055 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csrnp3P59055 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csrnp3P59055 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csrnp3P59055 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csrnp3P59055 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csrnp3P59055 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csrnp3P59055 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csrnp3P59055 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csrnp3P59055 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csrnp3P59055 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csrnp3P59055 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csrnp3P59055 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csrnp3P59055 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csrnp3P59055 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Csrnp3P59055 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Csrnp3P59055 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Csrnp3P59055 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Csrnp3P59055 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Csrnp3P59055 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Csrnp3P59055 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Csrnp3P59055 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Csrnp3P59055 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Csrnp3P59055 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Csrnp3P59055 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Csrnp3P59055 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Csrnp3P59055 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Csrnp3P59055 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Csrnp3P59055 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Csrnp3P59055 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Csrnp3P59055 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Csrnp3P59055 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Csrnp3P59055 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Csrnp3P59055 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Csrnp3P59055 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Csrnp3P59055 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Csrnp3P59055 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Csrnp3P59055 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms