Protein–RNA interactions for Protein: P58854

Tubgcp3, Gamma-tubulin complex component 3, mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp3P58854 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubgcp3P58854 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms