Protein–RNA interactions for Protein: P58242

Smpdl3b, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3bP58242 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms