Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp5P56399 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp5P56399 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp5P56399 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp5P56399 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp5P56399 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp5P56399 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp5P56399 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp5P56399 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp5P56399 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp5P56399 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp5P56399 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms