Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtskP55097 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtskP55097 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtskP55097 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtskP55097 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CtskP55097 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtskP55097 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtskP55097 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtskP55097 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtskP55097 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtskP55097 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtskP55097 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtskP55097 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtskP55097 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtskP55097 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtskP55097 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtskP55097 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtskP55097 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtskP55097 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtskP55097 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtskP55097 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtskP55097 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtskP55097 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtskP55097 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtskP55097 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtskP55097 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtskP55097 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtskP55097 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtskP55097 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtskP55097 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtskP55097 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtskP55097 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtskP55097 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtskP55097 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtskP55097 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtskP55097 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtskP55097 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtskP55097 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtskP55097 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtskP55097 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtskP55097 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtskP55097 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtskP55097 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtskP55097 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtskP55097 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtskP55097 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtskP55097 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtskP55097 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtskP55097 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtskP55097 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtskP55097 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtskP55097 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CtskP55097 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtskP55097 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CtskP55097 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtskP55097 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtskP55097 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtskP55097 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtskP55097 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtskP55097 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtskP55097 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CtskP55097 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtskP55097 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtskP55097 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtskP55097 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtskP55097 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtskP55097 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtskP55097 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtskP55097 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtskP55097 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtskP55097 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtskP55097 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtskP55097 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtskP55097 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CtskP55097 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtskP55097 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtskP55097 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtskP55097 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtskP55097 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CtskP55097 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtskP55097 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtskP55097 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtskP55097 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtskP55097 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtskP55097 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtskP55097 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtskP55097 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CtskP55097 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtskP55097 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CtskP55097 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtskP55097 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CtskP55097 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtskP55097 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtskP55097 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtskP55097 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtskP55097 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtskP55097 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtskP55097 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtskP55097 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtskP55097 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms