Protein–RNA interactions for Protein: P55014

Slc12a1, Solute carrier family 12 member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,095 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a1P55014 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc12a1P55014 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms