Protein–RNA interactions for Protein: P51944

Ccnf, Cyclin-F, mousemouse

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Length 777 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnfP51944 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CcnfP51944 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcnfP51944 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcnfP51944 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcnfP51944 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CcnfP51944 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CcnfP51944 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CcnfP51944 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcnfP51944 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcnfP51944 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcnfP51944 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcnfP51944 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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