Protein–RNA interactions for Protein: P51655

Gpc4, Glypican-4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc4P51655 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpc4P51655 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpc4P51655 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpc4P51655 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpc4P51655 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpc4P51655 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpc4P51655 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpc4P51655 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpc4P51655 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpc4P51655 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpc4P51655 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpc4P51655 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpc4P51655 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpc4P51655 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpc4P51655 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpc4P51655 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpc4P51655 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpc4P51655 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpc4P51655 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpc4P51655 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpc4P51655 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpc4P51655 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpc4P51655 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpc4P51655 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpc4P51655 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpc4P51655 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpc4P51655 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpc4P51655 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpc4P51655 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpc4P51655 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpc4P51655 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpc4P51655 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpc4P51655 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpc4P51655 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpc4P51655 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpc4P51655 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpc4P51655 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpc4P51655 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpc4P51655 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpc4P51655 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpc4P51655 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpc4P51655 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpc4P51655 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpc4P51655 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpc4P51655 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpc4P51655 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpc4P51655 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpc4P51655 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpc4P51655 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpc4P51655 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpc4P51655 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpc4P51655 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpc4P51655 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpc4P51655 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpc4P51655 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpc4P51655 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpc4P51655 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpc4P51655 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpc4P51655 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpc4P51655 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpc4P51655 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpc4P51655 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpc4P51655 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpc4P51655 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpc4P51655 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpc4P51655 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpc4P51655 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gpc4P51655 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gpc4P51655 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gpc4P51655 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gpc4P51655 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gpc4P51655 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gpc4P51655 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gpc4P51655 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gpc4P51655 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gpc4P51655 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gpc4P51655 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gpc4P51655 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc4P51655 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc4P51655 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc4P51655 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc4P51655 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc4P51655 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc4P51655 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc4P51655 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc4P51655 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc4P51655 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc4P51655 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc4P51655 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc4P51655 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc4P51655 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc4P51655 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc4P51655 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc4P51655 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc4P51655 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc4P51655 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc4P51655 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc4P51655 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc4P51655 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc4P51655 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms