Protein–RNA interactions for Protein: P50708

Defa10, Alpha-defensin 10, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa10P50708 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa10P50708 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa10P50708 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa10P50708 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa10P50708 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa10P50708 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa10P50708 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa10P50708 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa10P50708 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa10P50708 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa10P50708 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa10P50708 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa10P50708 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa10P50708 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa10P50708 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa10P50708 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa10P50708 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa10P50708 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa10P50708 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa10P50708 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa10P50708 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa10P50708 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa10P50708 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa10P50708 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa10P50708 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa10P50708 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa10P50708 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa10P50708 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa10P50708 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa10P50708 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa10P50708 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa10P50708 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa10P50708 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa10P50708 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa10P50708 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa10P50708 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa10P50708 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa10P50708 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa10P50708 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa10P50708 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa10P50708 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa10P50708 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa10P50708 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa10P50708 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa10P50708 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa10P50708 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa10P50708 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa10P50708 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa10P50708 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa10P50708 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa10P50708 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa10P50708 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa10P50708 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa10P50708 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa10P50708 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa10P50708 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa10P50708 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa10P50708 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa10P50708 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa10P50708 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa10P50708 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa10P50708 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa10P50708 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa10P50708 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa10P50708 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa10P50708 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa10P50708 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa10P50708 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa10P50708 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa10P50708 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa10P50708 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa10P50708 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa10P50708 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa10P50708 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa10P50708 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa10P50708 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa10P50708 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa10P50708 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa10P50708 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa10P50708 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa10P50708 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa10P50708 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa10P50708 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa10P50708 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa10P50708 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa10P50708 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa10P50708 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa10P50708 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa10P50708 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa10P50708 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa10P50708 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa10P50708 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa10P50708 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa10P50708 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa10P50708 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa10P50708 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa10P50708 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa10P50708 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa10P50708 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa10P50708 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms