Protein–RNA interactions for Protein: P50706

Defa8, Alpha-defensin 8 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa8P50706 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Defa8P50706 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Defa8P50706 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Defa8P50706 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Defa8P50706 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms