Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms