Protein–RNA interactions for Protein: P50136

Bckdha, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdhaP50136 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BckdhaP50136 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BckdhaP50136 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.02■□□□□ -0
BckdhaP50136 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.02■□□□□ -0
BckdhaP50136 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BckdhaP50136 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.02■□□□□ -0
BckdhaP50136 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.02■□□□□ -0
BckdhaP50136 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.02■□□□□ -0
BckdhaP50136 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.02■□□□□ -0
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BckdhaP50136 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.02■□□□□ -0
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BckdhaP50136 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.02■□□□□ -0
BckdhaP50136 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.02■□□□□ -0
BckdhaP50136 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
BckdhaP50136 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BckdhaP50136 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BckdhaP50136 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
BckdhaP50136 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BckdhaP50136 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BckdhaP50136 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BckdhaP50136 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BckdhaP50136 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BckdhaP50136 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BckdhaP50136 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BckdhaP50136 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BckdhaP50136 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BckdhaP50136 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BckdhaP50136 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BckdhaP50136 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BckdhaP50136 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BckdhaP50136 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BckdhaP50136 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BckdhaP50136 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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BckdhaP50136 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BckdhaP50136 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BckdhaP50136 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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BckdhaP50136 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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BckdhaP50136 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BckdhaP50136 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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BckdhaP50136 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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BckdhaP50136 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BckdhaP50136 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BckdhaP50136 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BckdhaP50136 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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BckdhaP50136 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BckdhaP50136 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BckdhaP50136 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15□□□□□ -0.01
BckdhaP50136 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BckdhaP50136 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BckdhaP50136 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BckdhaP50136 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BckdhaP50136 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BckdhaP50136 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BckdhaP50136 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BckdhaP50136 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BckdhaP50136 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BckdhaP50136 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
BckdhaP50136 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BckdhaP50136 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BckdhaP50136 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BckdhaP50136 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BckdhaP50136 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BckdhaP50136 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
BckdhaP50136 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
BckdhaP50136 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
BckdhaP50136 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BckdhaP50136 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BckdhaP50136 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BckdhaP50136 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BckdhaP50136 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BckdhaP50136 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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