Protein–RNA interactions for Protein: P49710

Hcls1, Hematopoietic lineage cell-specific protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcls1P49710 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms