Protein–RNA interactions for Protein: P49452

Cenpc, Centromere protein C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpcP49452 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CenpcP49452 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CenpcP49452 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CenpcP49452 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CenpcP49452 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CenpcP49452 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CenpcP49452 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CenpcP49452 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CenpcP49452 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CenpcP49452 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CenpcP49452 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CenpcP49452 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CenpcP49452 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CenpcP49452 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CenpcP49452 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CenpcP49452 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CenpcP49452 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CenpcP49452 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CenpcP49452 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CenpcP49452 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CenpcP49452 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CenpcP49452 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CenpcP49452 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CenpcP49452 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CenpcP49452 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CenpcP49452 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CenpcP49452 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CenpcP49452 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CenpcP49452 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CenpcP49452 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CenpcP49452 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CenpcP49452 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CenpcP49452 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CenpcP49452 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CenpcP49452 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CenpcP49452 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CenpcP49452 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CenpcP49452 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CenpcP49452 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CenpcP49452 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CenpcP49452 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CenpcP49452 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CenpcP49452 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CenpcP49452 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CenpcP49452 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CenpcP49452 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CenpcP49452 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CenpcP49452 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CenpcP49452 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CenpcP49452 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CenpcP49452 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CenpcP49452 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CenpcP49452 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CenpcP49452 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CenpcP49452 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CenpcP49452 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CenpcP49452 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CenpcP49452 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CenpcP49452 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CenpcP49452 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CenpcP49452 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CenpcP49452 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CenpcP49452 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CenpcP49452 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CenpcP49452 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CenpcP49452 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CenpcP49452 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CenpcP49452 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CenpcP49452 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CenpcP49452 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CenpcP49452 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CenpcP49452 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CenpcP49452 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CenpcP49452 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CenpcP49452 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CenpcP49452 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CenpcP49452 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CenpcP49452 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CenpcP49452 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CenpcP49452 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CenpcP49452 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CenpcP49452 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CenpcP49452 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CenpcP49452 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CenpcP49452 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CenpcP49452 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CenpcP49452 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CenpcP49452 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CenpcP49452 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CenpcP49452 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CenpcP49452 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CenpcP49452 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CenpcP49452 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CenpcP49452 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CenpcP49452 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CenpcP49452 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CenpcP49452 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CenpcP49452 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CenpcP49452 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CenpcP49452 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms