Protein–RNA interactions for Protein: P48772

Cox8b, Cytochrome c oxidase subunit 8B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox8bP48772 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cox8bP48772 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cox8bP48772 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cox8bP48772 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cox8bP48772 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cox8bP48772 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cox8bP48772 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cox8bP48772 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cox8bP48772 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cox8bP48772 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cox8bP48772 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cox8bP48772 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cox8bP48772 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cox8bP48772 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cox8bP48772 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cox8bP48772 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cox8bP48772 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cox8bP48772 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cox8bP48772 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cox8bP48772 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cox8bP48772 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cox8bP48772 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cox8bP48772 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cox8bP48772 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cox8bP48772 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cox8bP48772 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cox8bP48772 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cox8bP48772 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cox8bP48772 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cox8bP48772 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cox8bP48772 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cox8bP48772 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cox8bP48772 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cox8bP48772 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cox8bP48772 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cox8bP48772 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cox8bP48772 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cox8bP48772 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cox8bP48772 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cox8bP48772 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cox8bP48772 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cox8bP48772 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cox8bP48772 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cox8bP48772 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cox8bP48772 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cox8bP48772 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cox8bP48772 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cox8bP48772 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cox8bP48772 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cox8bP48772 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cox8bP48772 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cox8bP48772 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cox8bP48772 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cox8bP48772 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cox8bP48772 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cox8bP48772 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cox8bP48772 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cox8bP48772 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cox8bP48772 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cox8bP48772 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cox8bP48772 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cox8bP48772 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cox8bP48772 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cox8bP48772 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cox8bP48772 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cox8bP48772 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cox8bP48772 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cox8bP48772 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cox8bP48772 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cox8bP48772 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cox8bP48772 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cox8bP48772 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cox8bP48772 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cox8bP48772 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms