Protein–RNA interactions for Protein: P47993

Xcl1, Lymphotactin, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Xcl1P47993 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Xcl1P47993 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Xcl1P47993 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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