Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gli1P47806 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gli1P47806 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gli1P47806 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gli1P47806 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gli1P47806 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gli1P47806 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms