Protein–RNA interactions for Protein: P47774

Ccr7, C-C chemokine receptor type 7, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr7P47774 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccr7P47774 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccr7P47774 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccr7P47774 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccr7P47774 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccr7P47774 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccr7P47774 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr7P47774 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr7P47774 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr7P47774 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr7P47774 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr7P47774 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr7P47774 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr7P47774 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr7P47774 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr7P47774 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr7P47774 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr7P47774 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr7P47774 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr7P47774 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr7P47774 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr7P47774 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr7P47774 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr7P47774 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr7P47774 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr7P47774 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr7P47774 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr7P47774 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr7P47774 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr7P47774 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr7P47774 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr7P47774 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr7P47774 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr7P47774 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccr7P47774 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccr7P47774 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccr7P47774 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccr7P47774 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccr7P47774 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccr7P47774 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccr7P47774 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccr7P47774 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccr7P47774 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccr7P47774 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccr7P47774 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccr7P47774 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccr7P47774 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccr7P47774 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccr7P47774 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccr7P47774 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccr7P47774 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccr7P47774 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccr7P47774 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccr7P47774 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccr7P47774 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccr7P47774 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccr7P47774 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccr7P47774 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccr7P47774 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccr7P47774 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccr7P47774 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccr7P47774 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccr7P47774 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccr7P47774 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccr7P47774 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccr7P47774 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccr7P47774 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccr7P47774 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccr7P47774 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccr7P47774 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccr7P47774 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccr7P47774 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccr7P47774 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccr7P47774 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccr7P47774 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccr7P47774 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccr7P47774 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccr7P47774 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccr7P47774 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccr7P47774 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccr7P47774 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccr7P47774 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccr7P47774 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccr7P47774 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccr7P47774 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccr7P47774 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccr7P47774 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccr7P47774 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccr7P47774 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccr7P47774 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccr7P47774 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccr7P47774 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccr7P47774 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccr7P47774 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccr7P47774 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccr7P47774 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccr7P47774 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccr7P47774 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccr7P47774 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccr7P47774 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms