Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nkx1-2P42580 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nkx1-2P42580 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nkx1-2P42580 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nkx1-2P42580 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nkx1-2P42580 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nkx1-2P42580 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nkx1-2P42580 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nkx1-2P42580 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nkx1-2P42580 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nkx1-2P42580 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nkx1-2P42580 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nkx1-2P42580 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nkx1-2P42580 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nkx1-2P42580 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nkx1-2P42580 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nkx1-2P42580 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms