Protein–RNA interactions for Protein: P42209

Sept1, Septin-1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept1P42209 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sept1P42209 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sept1P42209 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sept1P42209 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sept1P42209 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sept1P42209 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sept1P42209 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sept1P42209 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sept1P42209 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sept1P42209 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sept1P42209 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sept1P42209 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sept1P42209 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sept1P42209 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sept1P42209 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sept1P42209 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sept1P42209 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sept1P42209 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sept1P42209 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sept1P42209 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sept1P42209 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sept1P42209 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sept1P42209 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sept1P42209 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sept1P42209 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sept1P42209 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sept1P42209 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sept1P42209 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sept1P42209 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sept1P42209 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sept1P42209 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sept1P42209 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sept1P42209 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sept1P42209 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sept1P42209 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sept1P42209 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sept1P42209 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sept1P42209 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sept1P42209 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sept1P42209 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sept1P42209 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sept1P42209 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sept1P42209 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sept1P42209 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sept1P42209 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sept1P42209 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sept1P42209 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sept1P42209 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sept1P42209 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sept1P42209 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sept1P42209 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sept1P42209 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sept1P42209 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sept1P42209 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sept1P42209 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sept1P42209 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sept1P42209 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sept1P42209 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sept1P42209 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sept1P42209 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sept1P42209 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sept1P42209 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sept1P42209 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sept1P42209 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sept1P42209 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sept1P42209 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sept1P42209 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sept1P42209 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sept1P42209 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sept1P42209 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sept1P42209 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sept1P42209 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sept1P42209 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sept1P42209 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sept1P42209 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sept1P42209 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sept1P42209 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sept1P42209 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sept1P42209 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sept1P42209 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sept1P42209 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sept1P42209 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sept1P42209 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sept1P42209 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sept1P42209 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sept1P42209 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sept1P42209 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sept1P42209 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sept1P42209 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sept1P42209 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sept1P42209 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sept1P42209 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sept1P42209 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sept1P42209 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sept1P42209 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sept1P42209 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sept1P42209 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sept1P42209 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sept1P42209 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sept1P42209 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms