Protein–RNA interactions for Protein: P40336

Vps26a, Vacuolar protein sorting-associated protein 26A, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps26aP40336 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms