Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Traf2P39429 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Traf2P39429 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Traf2P39429 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Traf2P39429 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Traf2P39429 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Traf2P39429 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Traf2P39429 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Traf2P39429 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Traf2P39429 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf2P39429 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf2P39429 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms