Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lig1P37913 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lig1P37913 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lig1P37913 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lig1P37913 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lig1P37913 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Lig1P37913 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms