Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc11P31313 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc11P31313 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc11P31313 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc11P31313 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc11P31313 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc11P31313 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc11P31313 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc11P31313 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc11P31313 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc11P31313 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc11P31313 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc11P31313 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc11P31313 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc11P31313 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc11P31313 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc11P31313 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc11P31313 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc11P31313 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc11P31313 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc11P31313 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc11P31313 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc11P31313 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc11P31313 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc11P31313 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc11P31313 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc11P31313 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc11P31313 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc11P31313 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc11P31313 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
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Hoxc11P31313 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.02■□□□□ -0
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Hoxc11P31313 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc11P31313 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc11P31313 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Hoxc11P31313 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Hoxc11P31313 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Hoxc11P31313 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Hoxc11P31313 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Hoxc11P31313 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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Hoxc11P31313 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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