Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms