Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RxraP28700 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RxraP28700 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RxraP28700 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RxraP28700 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RxraP28700 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RxraP28700 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RxraP28700 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RxraP28700 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RxraP28700 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RxraP28700 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RxraP28700 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RxraP28700 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RxraP28700 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RxraP28700 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RxraP28700 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RxraP28700 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RxraP28700 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RxraP28700 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RxraP28700 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RxraP28700 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RxraP28700 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RxraP28700 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RxraP28700 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RxraP28700 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RxraP28700 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RxraP28700 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RxraP28700 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RxraP28700 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RxraP28700 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RxraP28700 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RxraP28700 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RxraP28700 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RxraP28700 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RxraP28700 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RxraP28700 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RxraP28700 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RxraP28700 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RxraP28700 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RxraP28700 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RxraP28700 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RxraP28700 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RxraP28700 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RxraP28700 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RxraP28700 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RxraP28700 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RxraP28700 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RxraP28700 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RxraP28700 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RxraP28700 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RxraP28700 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RxraP28700 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RxraP28700 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RxraP28700 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RxraP28700 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RxraP28700 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RxraP28700 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RxraP28700 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RxraP28700 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RxraP28700 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RxraP28700 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RxraP28700 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RxraP28700 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RxraP28700 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RxraP28700 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RxraP28700 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RxraP28700 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RxraP28700 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RxraP28700 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RxraP28700 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RxraP28700 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RxraP28700 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RxraP28700 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RxraP28700 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RxraP28700 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RxraP28700 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RxraP28700 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RxraP28700 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RxraP28700 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RxraP28700 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RxraP28700 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RxraP28700 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RxraP28700 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RxraP28700 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RxraP28700 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RxraP28700 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RxraP28700 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RxraP28700 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RxraP28700 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RxraP28700 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RxraP28700 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RxraP28700 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RxraP28700 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RxraP28700 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RxraP28700 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RxraP28700 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RxraP28700 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RxraP28700 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RxraP28700 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RxraP28700 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms