Protein–RNA interactions for Protein: P28667

Marcksl1, MARCKS-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Marcksl1P28667 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Marcksl1P28667 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Marcksl1P28667 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Marcksl1P28667 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Marcksl1P28667 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Marcksl1P28667 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Marcksl1P28667 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Marcksl1P28667 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Marcksl1P28667 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Marcksl1P28667 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Marcksl1P28667 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Marcksl1P28667 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Marcksl1P28667 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Marcksl1P28667 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Marcksl1P28667 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Marcksl1P28667 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Marcksl1P28667 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Marcksl1P28667 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Marcksl1P28667 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Marcksl1P28667 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Marcksl1P28667 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Marcksl1P28667 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Marcksl1P28667 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Marcksl1P28667 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Marcksl1P28667 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Marcksl1P28667 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Marcksl1P28667 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Marcksl1P28667 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Marcksl1P28667 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Marcksl1P28667 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Marcksl1P28667 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Marcksl1P28667 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Marcksl1P28667 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Marcksl1P28667 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Marcksl1P28667 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Marcksl1P28667 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Marcksl1P28667 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Marcksl1P28667 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Marcksl1P28667 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Marcksl1P28667 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Marcksl1P28667 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Marcksl1P28667 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Marcksl1P28667 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Marcksl1P28667 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Marcksl1P28667 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Marcksl1P28667 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Marcksl1P28667 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Marcksl1P28667 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Marcksl1P28667 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Marcksl1P28667 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Marcksl1P28667 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Marcksl1P28667 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Marcksl1P28667 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Marcksl1P28667 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Marcksl1P28667 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Marcksl1P28667 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Marcksl1P28667 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Marcksl1P28667 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Marcksl1P28667 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Marcksl1P28667 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Marcksl1P28667 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Marcksl1P28667 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Marcksl1P28667 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Marcksl1P28667 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Marcksl1P28667 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Marcksl1P28667 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Marcksl1P28667 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Marcksl1P28667 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Marcksl1P28667 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Marcksl1P28667 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Marcksl1P28667 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Marcksl1P28667 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Marcksl1P28667 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Marcksl1P28667 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Marcksl1P28667 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Marcksl1P28667 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Marcksl1P28667 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Marcksl1P28667 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Marcksl1P28667 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Marcksl1P28667 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Marcksl1P28667 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Marcksl1P28667 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Marcksl1P28667 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Marcksl1P28667 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Marcksl1P28667 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Marcksl1P28667 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Marcksl1P28667 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Marcksl1P28667 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Marcksl1P28667 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Marcksl1P28667 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Marcksl1P28667 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Marcksl1P28667 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Marcksl1P28667 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Marcksl1P28667 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Marcksl1P28667 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Marcksl1P28667 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Marcksl1P28667 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Marcksl1P28667 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Marcksl1P28667 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Marcksl1P28667 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms