Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

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Length 298 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NapbP28663 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NapbP28663 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NapbP28663 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NapbP28663 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NapbP28663 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NapbP28663 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NapbP28663 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NapbP28663 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NapbP28663 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NapbP28663 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NapbP28663 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NapbP28663 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NapbP28663 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NapbP28663 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NapbP28663 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NapbP28663 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NapbP28663 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NapbP28663 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NapbP28663 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NapbP28663 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NapbP28663 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NapbP28663 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NapbP28663 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NapbP28663 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NapbP28663 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NapbP28663 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NapbP28663 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NapbP28663 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NapbP28663 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NapbP28663 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NapbP28663 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NapbP28663 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NapbP28663 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NapbP28663 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NapbP28663 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NapbP28663 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NapbP28663 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NapbP28663 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NapbP28663 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NapbP28663 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NapbP28663 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NapbP28663 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NapbP28663 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NapbP28663 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NapbP28663 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NapbP28663 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NapbP28663 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NapbP28663 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NapbP28663 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NapbP28663 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NapbP28663 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NapbP28663 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NapbP28663 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NapbP28663 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NapbP28663 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NapbP28663 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NapbP28663 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NapbP28663 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NapbP28663 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NapbP28663 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NapbP28663 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NapbP28663 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NapbP28663 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NapbP28663 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NapbP28663 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NapbP28663 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NapbP28663 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NapbP28663 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NapbP28663 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NapbP28663 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NapbP28663 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NapbP28663 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NapbP28663 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NapbP28663 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NapbP28663 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NapbP28663 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NapbP28663 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NapbP28663 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NapbP28663 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NapbP28663 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NapbP28663 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NapbP28663 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NapbP28663 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NapbP28663 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NapbP28663 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NapbP28663 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NapbP28663 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NapbP28663 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NapbP28663 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NapbP28663 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NapbP28663 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NapbP28663 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NapbP28663 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NapbP28663 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NapbP28663 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NapbP28663 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NapbP28663 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NapbP28663 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NapbP28663 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms