Protein–RNA interactions for Protein: P28658

Atxn10, Ataxin-10, mousemouse

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Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn10P28658 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Atxn10P28658 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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Atxn10P28658 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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Atxn10P28658 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Atxn10P28658 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Atxn10P28658 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Atxn10P28658 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Atxn10P28658 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Atxn10P28658 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Atxn10P28658 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atxn10P28658 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atxn10P28658 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atxn10P28658 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atxn10P28658 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atxn10P28658 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atxn10P28658 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atxn10P28658 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Atxn10P28658 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms