Protein–RNA interactions for Protein: P28235

Gja4, Gap junction alpha-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja4P28235 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja4P28235 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja4P28235 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja4P28235 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja4P28235 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja4P28235 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja4P28235 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja4P28235 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja4P28235 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja4P28235 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja4P28235 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms