Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tap1P21958 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tap1P21958 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tap1P21958 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tap1P21958 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tap1P21958 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tap1P21958 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tap1P21958 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tap1P21958 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tap1P21958 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tap1P21958 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms