Protein–RNA interactions for Protein: P21619

Lmnb2, Lamin-B2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb2P21619 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmnb2P21619 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmnb2P21619 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmnb2P21619 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmnb2P21619 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmnb2P21619 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmnb2P21619 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmnb2P21619 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmnb2P21619 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmnb2P21619 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmnb2P21619 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmnb2P21619 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmnb2P21619 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmnb2P21619 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmnb2P21619 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmnb2P21619 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmnb2P21619 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmnb2P21619 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmnb2P21619 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmnb2P21619 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmnb2P21619 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmnb2P21619 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmnb2P21619 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmnb2P21619 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmnb2P21619 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmnb2P21619 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmnb2P21619 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmnb2P21619 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmnb2P21619 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmnb2P21619 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmnb2P21619 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmnb2P21619 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmnb2P21619 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmnb2P21619 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmnb2P21619 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmnb2P21619 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmnb2P21619 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmnb2P21619 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmnb2P21619 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmnb2P21619 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmnb2P21619 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmnb2P21619 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmnb2P21619 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmnb2P21619 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmnb2P21619 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmnb2P21619 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmnb2P21619 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmnb2P21619 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmnb2P21619 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmnb2P21619 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmnb2P21619 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmnb2P21619 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmnb2P21619 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmnb2P21619 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmnb2P21619 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmnb2P21619 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmnb2P21619 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmnb2P21619 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmnb2P21619 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmnb2P21619 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmnb2P21619 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmnb2P21619 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmnb2P21619 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmnb2P21619 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmnb2P21619 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmnb2P21619 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmnb2P21619 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmnb2P21619 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmnb2P21619 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmnb2P21619 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmnb2P21619 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmnb2P21619 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmnb2P21619 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmnb2P21619 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmnb2P21619 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmnb2P21619 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmnb2P21619 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms