Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TP20293 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TP20293 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TP20293 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TP20293 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TP20293 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TP20293 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TP20293 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TP20293 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TP20293 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TP20293 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TP20293 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TP20293 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TP20293 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TP20293 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TP20293 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TP20293 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TP20293 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TP20293 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TP20293 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TP20293 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TP20293 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TP20293 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TP20293 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TP20293 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TP20293 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TP20293 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TP20293 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TP20293 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TP20293 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TP20293 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TP20293 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TP20293 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TP20293 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TP20293 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TP20293 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TP20293 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TP20293 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TP20293 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TP20293 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TP20293 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TP20293 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TP20293 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TP20293 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TP20293 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TP20293 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TP20293 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TP20293 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TP20293 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TP20293 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TP20293 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TP20293 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TP20293 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TP20293 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TP20293 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TP20293 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TP20293 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TP20293 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TP20293 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TP20293 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TP20293 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TP20293 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TP20293 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TP20293 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TP20293 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TP20293 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TP20293 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TP20293 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TP20293 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TP20293 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TP20293 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TP20293 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TP20293 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TP20293 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TP20293 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TP20293 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TP20293 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TP20293 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TP20293 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TP20293 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TP20293 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TP20293 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TP20293 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TP20293 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TP20293 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TP20293 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TP20293 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TP20293 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TP20293 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TP20293 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TP20293 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TP20293 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TP20293 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TP20293 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TP20293 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TP20293 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TP20293 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TP20293 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TP20293 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TP20293 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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