Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
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