Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.2 ms