Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms