Protein–RNA interactions for Protein: P18527

Ig heavy chain V region 914, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18527 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18527 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18527 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18527 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18527 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18527 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18527 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18527 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18527 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18527 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18527 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18527 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18527 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18527 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18527 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18527 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18527 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18527 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18527 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18527 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18527 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18527 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18527 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18527 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18527 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
P18527 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18527 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18527 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18527 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
P18527 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18527 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
P18527 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
P18527 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18527 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18527 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18527 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18527 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18527 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18527 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18527 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
P18527 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18527 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18527 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18527 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18527 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18527 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18527 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18527 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18527 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18527 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18527 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18527 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18527 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18527 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18527 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18527 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18527 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18527 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18527 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18527 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18527 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18527 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18527 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18527 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18527 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18527 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18527 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18527 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18527 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18527 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18527 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18527 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18527 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18527 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18527 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
P18527 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18527 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18527 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18527 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18527 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18527 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18527 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18527 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18527 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18527 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18527 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18527 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18527 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18527 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18527 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18527 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18527 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18527 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18527 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18527 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18527 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18527 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18527 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18527 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18527 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms